С обнаружением инопланетного органического корабля, затонувшего в океане, раскрывается план группы ученых стереть человечество с лица Земли. С началом разрушения из земной коры появляются странные металлические тарелки, впоследствии трансформирующиеся в Антитела. На фоне глобальных катастроф пересекаются пути Исами Юу и Утсумийи Химе. На первый взгляд у них ничего общего, только то, что они пилотируют антитела, но их судьбы связаны как между собой, так и с судьбой всего мира